La galaxie est en proie à la Guerre des Clones, entre les séparatistes et leurs armées d’androïdes et la République et ses protecteurs Jedi.
Le jeune Jedi Anakin Skywalker et son apprenti Padawan Ahsoka Tano sont alors chargés d’une mission qui va les confronter à l'affreux Jabba the Hutt.
Pendant ce temps-là, Le Comte Dooku se lance après à leur poursuite avec ses sinistres agents.
Au même moment, Maître Obi-Wan Kenobi et Maître Yoda tentent de préparer l’armée des clones à résister aux forces des Ténèbres et lutter contre l'invasion...
